本发明公开了一种高浓度有机废水快速启动厌氧反应器的方法，包括步骤：把经过预处理过的污泥混合液接种到待启动的厌氧反应器中，对厌氧反应器第一阶段进水启动，保持水力停留时间为48小时不变，进水浓度从设计浓度值的20%以下，逐步提高进水浓度至设计浓度值；在第一阶段的启动后再次往厌氧反应器中接种污泥，并再次对厌氧反应器第二阶段进水启动，将进水浓度保持设计浓度值不变，分阶段逐步降低水力停留时间至设计浓度值，反应器启动成功。通过对接种及反应器启动过程的优化控制，实现反应器的快速启动，减少碱度的投加量，并且防止启动过程中反应器酸化现象的发生。