本发明属于环境保护技术领域，公开一种公路附属设施污水多介质生物生态协同处理系统及方法，该系统是由多介质固定生物床和多介质潮汐流生态湿地构成。所述系统处理方法的步骤如下：污水由提升泵提升进入多介质固定生物床，在微动力通风的条件下，多介质固定生物床将有机物和氨氮得到有效降解，多介质固定生物床出水进入潮汐流人工湿地，进一步去除总氮和总磷。本发明的优点是将多介质固定生物床与潮汐流人工湿地有机组合，发挥各自的功能优势，达到同时高效率去除污水中有机物、氨氮、总氮和总磷的目的。该系统投资少，运行成本低，基本不产生剩余污泥、低维护、无人值守，可实现公路附属设施污水的深度脱氮除磷及资源化回用。