本发明涉及一种催化内电解耦合两级生物滤池深度处理焦化废水的方法，以催化内电解法作为主要的处理工艺，对焦化废水生化出水进行预处理，提高废水的可生化性，然后耦合两级生物滤池作为生物处理进一步降解废水中污染物。本发明结合了电化学与生物化学的方法对焦化废水中污染物进行降解去除，具有较高的抗冲击负荷能力，并且在整个系统中能同步实现COD、氨氮和总氮的去除，出水色度大幅度的下降，经上述工艺处理后的出水水质优良，可以稳定达到《炼焦化学工业污染物排放标准》（GB16171-2012）。