本发明公开了一种基于生物化学处理的高盐度工业废水处理方法，包括：将高盐度工业废水导入浸没式超滤系统，过滤废水中的胶体和颗粒物；导入电渗析系统，对废水进行一级脱盐；淡水调节PH至6.2～6.5，再导入反渗透系统进行二级脱盐；导入生物接触氧化系统，对废水进行三级脱盐，去除废水中的COD；将经生物接触氧化处理后的废水导入二沉池进行沉淀。本发明废水经过浸没式超滤、电渗析和反渗透处理后，再经生物接触氧化处理，将物理化学法与生物化学法结合起来治理高盐度工业废水，经三级脱盐处理，有效去除了废水中的盐分；净化效率高，效果良好，COD为2370mg/L、含盐量为1.2％～1.7％的废水经本发明处理后，出水BOD₅小于30mg/L，COD小于100mg/L，COD去除率达到96％。