本发明公开一种去除废水中全氟有机污染物的方法，其中，包括步骤：在全氟有机污染物的初始浓度为50mg/L～500mg/L的待处理水体中，以铁板或铝板材料为阳极，将阳极在恒电流电解条件下进行电絮凝处理，电絮凝初始时按2mLH₂O₂/L溶液的比例投加一次双氧水，随着电絮凝进行每间隔10～30min再投加与初始量相同的双氧水，电絮凝处理时间为60～120min。本发明所提供的全氟有机污染物处理方法，简单易行，高效稳定，本发明的方法以铁板或铝板作为阳极材料，在电场和双氧水的作用下，促进絮体生成，实现对PFOA、PFOS的增效吸附去除，可在未增加其他化学试剂的情况下即可到达较佳的净化效果。