一种三层滴滤池深度处理畜禽废水的方法，畜禽废水由离心机进料口进入，对不同密度的悬浮液进行沉降分层，分离出的污水进入滴滤池内；滴滤池内由旋转布水盘进行布水，先经生物环层对污水进行好氧处理，再经分子筛层对污水中的污染物质进行物理吸附及离子交换，通过砾石层再度处理及导水后，在沉淀层进行沉淀，经沉淀的污水在液压泵的作用下导入涡轮流筛滤净化池内；涡轮流筛滤净化池内由纳米级别O₃气泡与紫外灭菌灯、半导体负载填料产生更多的羟基自由基·OH，增强O₃氧化分解有机物，提高高级氧化效果，有效提高·OH产生率，完成处理过程。本发明还公开了实现上述方法的装置。