本发明公开了一种生物柴油废水处理装置。隔油池、调节池、污水泵、中和反应池、混凝沉淀池、厌氧池、好氧池、生物沉淀池、活性炭过滤罐依次相连；所述的加药系统与中和反应池相连；所述的混凝沉淀池和生物沉淀池的出水口都是设于池上部的环形出水槽，在池中部设有导流筒，在池底部设有锥形集泥斗，混凝沉淀池的锥形集泥斗的底部设有出泥管，该出泥管与储泥池相连，生物沉淀池的锥形集泥斗的底部设有出泥管，该出泥管与污泥回流泵的入口相连，污泥回流泵的出口通过管道通入厌氧池底部；在厌氧池和好氧池中都设有填料架，在填料架中装有组合填料；在好氧池底部设有曝气管，曝气管与鼓风机相连；在加药系统中也设有曝气管，曝气管与鼓风机相连。