本发明涉及一种低硫高氮加氢原料的预处理方法，包括如下内容：（1）低硫高氮加氢原料与硫化氢充分混合，低硫高氮加氢原料中的金属杂质与硫化氢反应，同时部分硫化氢溶解吸附在低硫高氮加氢原料中，硫化氢来自加氢装置酸性污水汽提塔；（2）步骤（1）中混合物料进入沉降设备，脱除反应后的铁、钠和钙中至少一种金属杂质；（3）沉降设备排出的液相作为加氢装置原料，沉降设备顶部排出过量的硫化氢。本发明方法可以有效脱除原料中的金属杂质，同时对于低硫高氮加氢原料来说，可以不用补充硫化剂，保证装置的长周期稳定运转。