本发明公开了一种双交联两性木薯淀粉的制备方法。以木薯淀粉为主要原料，水为溶剂，氢氧化1-丁基-3-甲基咪唑和氢氧化钠为醚化反应的催化剂，以N，N′-亚甲基双丙烯酰胺为内交联剂使淀粉形成网状，再通过环氧氯丙烷外交联和二甲基二烯丙基氯化铵阳离子单体、一氯乙酸等两性试剂的改性制备一种双交联两性木薯淀粉，使木薯淀粉兼交联淀粉和两性淀粉的优势。本发明所得双交联两性木薯淀粉对热、酸和剪切力等的影响具有更高的稳定性。产品在造纸助剂和化妆品等方面具有较高的应用价值。同时，由于双交联两性木薯淀粉在水中溶胀而不溶解，在污水处理方面的应用效果更佳。