本发明涉及一种利用浮萍为原料制备2,3-丁二醇的方法，属于环境生物技术和生物质能源领域。本发明以水生植物浮萍为主要原料，采用液态发酵方法制备2,3-丁二醇。生产工艺包括：添加α-淀粉酶和糖化酶对浮萍悬液进行糖化处理；向液体种子培养基中接种多黏芽孢杆菌，通过摇床震荡培养获得液态种子；向装有预处理好的浮萍细胞液发酵罐中接种体积比为6-8%的液态种子，通过发酵得到液态发酵产物。本发明不仅解决了浮萍在污水净化过程中因大量繁殖而可能导致的二次污染，而且也为2,3-丁二醇的生物炼制提供了可再生的原料来源。特别是该法作为非粮作物的2,3-丁二醇发酵的替代法，还可以有效缓解世界范围内粮食短缺的紧张局面。