剔除重金属离子兼备微生物深层厌氧发酵双重工艺，成功地解决了有机肥料的重金属含量超标的难题，同时利用重金属剔除装置进行的微生物深层厌氧发酵能够缩短有机肥料生产周期。它不仅适用于生活垃圾制肥，凡是利用包含有机废物(有机质)在内的原料比如泥炭土、污泥、农副产品下脚料等生产有机肥料，均可采用本工艺剔除重金属。特别是能有效解决各地污水处理厂污泥(重金属含量很高)处理的难题，增加有机肥料的原料来源，促进有机农业的发展。经生活垃圾制肥厂实际应用，证明本工艺切实可行，剔除重金属离子和微生物厌氧发酵均达到预期效果。