本发明属于污水处理技术领域，具体涉及一种用于HIV防治药剂生产的废水处理系统。本废水处理系统包括如下组成部分：彼此并联的高浓度废水预处理段和低浓度废水预处理段，高、低浓度废水预处理段处理后的废水混合后自流至混凝沉淀处理段进行混凝沉淀处理，处理后的废水进入两相法厌氧反应处理段进行厌氧处理，然后再进入吹脱池进行氨氮和挥发性气体的吹脱处理，吹脱处理后的废水进入DAT_A-DAT_O-IATn处理段进行生化处理，经过生化处理后的水即可达标排放，污泥则排入污泥浓缩池进行脱水处理。本发明采用预处理+生化处理的原则布置流程，物料提升次数少且多为自流方式，操作和检修方便，加药量少，系统运行稳定，不会产生二次污染。