本发明提供了一种高效处理有机污水的微生物燃料电池人工湿地装置，属于污水处理与电化学耦合技术领域。其特征在于，人工湿地的多介质滤床中种植挺水植物组并布置多组曝气管及排气管，两侧设有入流布水区和出流集水区，分别连接供水系统、回流系统和排水系统，人工湿地由膨润土分为上、下两层分别布置至少一块石墨毡，下层为厌氧区(阳极室)由微生物氧化有机物产生电子和质子，上层为好氧区(阴极室)由植物及曝气管供氧，电子通过外电路传递到阴极形成电流，由于阴／阳极室氧化还原电位的不同产生电压从而构成微生物燃料电池人工湿地。本发明能同时去除有机物和产生电能，处理效果好，运行维护成本低，节能环保。