本发明提供了一种亚临界水提取黄芩中四种不同有效成份的方法，包括下述步骤：①将黄芩粉碎颗粒备用；②取黄芩颗粒与水置入萃取釜中，将萃取釜封闭后放在温度加热控制仪中，萃取釜中的物料在3-5分钟内冷却至室温，液渣分离后得到含黄芩素、汉黄芩素的液体；③在步骤②的滤渣内加水，封闭萃取釜，将萃取釜内的物料温度加热，保持28-32分钟后，降至室温，液渣分离弃渣，得到含黄芩苷、汉黄芩苷液体；④将步骤②中得到含黄芩素、汉黄芩素的液体和步骤③中的黄芩苷、汉黄芩苷的液体分别蒸除水份，分别得到黄芩素、汉黄芩素、黄芩苷和汉黄芩苷四种黄芩有效成份的粉状物。本发明使提取物纯度高，为制药提供所需黄芩的四种有效成份。