本发明涉及一种污水处理过程中分离活性蛋白的方法，包括以下步骤：污水一沉池中沉淀，然后经过调节池、UASB反应器、氧化池中处理后在二沉池中沉淀获得污泥，然后分离污泥中的活性蛋白。分离步骤包括：将污泥转移至污泥池中处理获得含有干物质的质量分数为4.5%-5.5%的活性蛋白浆料，然后进行过滤、洗涤、调节获得含干物质量分数为30%的活性蛋白物料后干燥至含88%-93%干物质的物料，粉碎，经过200目筛筛选，即得。本发明克服了现有技术中污水中的活性蛋白无法充分利用的问题，通过本发明获得的活性蛋白达到了饲料添加蛋白粉的质量要求，用于生产高蛋白饲料，提高了产品的附加值，增加了企业经济效益。