本发明公开了一种超疏水聚四氟乙烯中空纤维膜的制备方法。该方法是将聚四氟乙烯分散树脂粉末与助挤剂混合，压坯，将毛坯通过推压机挤出形成聚四氟乙烯中空管，然后通过硅溶胶对聚四氟乙烯中空管进行改性处理，后再在烘箱中进行纵向拉伸和烧结热定型，最后采用全氟硅烷进行渗透处理，得到超疏水聚四氟乙烯中空纤维膜。加工的超疏水聚四氟乙烯中空纤维膜外层平均孔径为0.10～1.0微米，内层平均孔径为5.0～20微米，表面水接触角为152～160度，本发明主要用于膜蒸馏分离过程，可用于海水淡化、工业废水处理和食品和生物制品的低温浓缩等领域。