一种二次电池内阻的实时在线估计方法，属于二次电池储能系统控制技术领域。本发明的目的在于提供一种仅需能够提供电池的端电压与负载电流，而无需另增加其它辅助硬件电路的二次电池内阻的实时在线估计方法。本发明基于标准电池等效电路模型，利用扩展卡尔曼滤波器的工作原理，构建算法所需的状态方程与观测方程，将电池的开路电压(V_OC)，欧姆内阻(R_O)，极化内阻(R_P)，极化电流(I_P)作为估计量，将实时测得的端电压(V_L)、负载电流作(I_L)以及两次采样的时间间隔Δt作为已知量；并根据传感器精度选取过程激励噪声协方差与测量噪声协方差，通过迭代更新，进而实时地估计出所测二次电池的欧姆内阻与极化内阻。与现有的内阻测试方法相比，本方法具有可实时在线估计，稳定性好，无需附加硬件测试电路的优点。