本发明公开了一种复合多层耦合系数精确计算方法，它包括以下步骤：（1）通过边界条件和FEM方法计算出复合多层耦合器耦合导体之间的储能关系；（2）获得传输线的电容阵；（3）获得有限元网格划分结构；（4）得到耦合度和特性阻抗随耦合线宽度变化的FEM对应关系；（5）得出复合多层耦合器的耦合系数。本发明将有限元法应用于复合多层耦合系数的计算中，解决了耦合器和电桥存在不均匀介质、其耦合度无法精确计算的问题，而且可适用于任意形状、任意填充等特殊场合；有限元法可以适用于非常复杂的研究区域，具有高效、通用性强、应用广泛等特点；计算方法实施起来十分简便，而且耦合系数的计算速度快、效率高，精确度高，可靠性好。