本发明公开了一种微电网并网运行模式切换孤岛运行模式的调控方法及系统，方法包括：根据实际应用需要对微电网内的设备按照重要程度进行投入和退出以及调控的优先级排序；并网时，实时采集微电网的运行数据信息和潮流分布信息，预先计算一旦微电网进入孤岛，失去主网电能功率后的功率平衡缺口数值，并按照设备优先级顺序，推演计算可瞬间投切或调节的分布式电源、负载设备、储能设备的功率调控动作，使在孤岛发生时瞬间可以建立新的功率平衡，生成针对不同设备的孤岛调控预案，并预先下达给相应设备的控制终端；当监测到孤岛时，将孤岛状态变化信息传送给控制终端，触发可控设备自动执行相应的孤岛调控预案，通过合理调控，使电能得到合理利用。