本申请公开了一种混合动力工程机械动力控制系统、控制器及控制方法，通过采集整流器的母线电压、储电单元的电压以及发动机的转速信息，合理控制储电单元的储能及放电过程，以及发动机工作状态，既能防止储电单元过充电和过放电，又能避免发动机频繁改变喷油量，从而实现了工程机械的节能减排效果。而且，动力系统控制器能够控制储电单元的充放电过程，优化了整个混合动力工程机械的动力系统。