本发明属于制药技术领域，为了解决吉西他滨盐酸盐的制备方法产业化成本较高，总体产率较低的问题，本发明提供了一种制备吉西他滨盐酸盐的方法，该方法包括：a、从式(I)中转化提取式(II)α端基异构体的步骤；b、式(II)与式(III)耦合得到式(IV)的步骤；c、获取式(V)吉西他滨盐酸盐的步骤；a步骤包括：①、将式(I)溶于至少含有R₁OH及与R₁OH成盐的三级有机胺的非质子溶剂中，加热回流，随后降温，以提高式(II)α端基异构体在式(I)端基异构体混合物中的摩尔比例；②、萃取式(I)，在重结晶液下降温使萃取产物重结晶，得到固体式(II)α端基异构体及式(I)重结晶溶液。