本发明涉及一种以无菌操作箱的方式改良自动补药工艺的方法。主要解决了现有的工业发酵中补药工艺操作繁琐，自动化程度不高，而且容易感染杂菌的问题。包括以下步骤：对加药罐、发酵罐以及管道系统进行蒸汽灭菌；把装有药剂的管体放入无菌操作箱内并灭菌；打开加药罐上的加药盖体并倒入药剂；输入指令，控制药剂通过管道输送到发酵罐内。整个装置以及装有药剂的管体均进行了彻底的灭菌，不会残留任何杂菌，提高了发酵的有效性，工艺操作简单，不繁琐；对药剂的控制完全采用自动化输送，科学高效，降低了成本。