本发明公开了一种双轴驱动电动汽车的制动系统及制动方法，所述制动系统包括整车控制装置及与其相连接的机械制动控制装置和再生制动控制装置，再生制动控制装置包括有前驱电机和后驱电机，前驱电机通过齿轮与电动汽车的前驱轮轴相连接，后驱电机通过齿轮与电动汽车的后驱轮轴相连接，再生制动控制装置还包括有前储能模块和后储能模块，前储能模块与前驱电机的控制器电连接，后储能模块与后驱电机的控制器电连接，前储能模块与后储能模块通过DC/DC转换器电连接。本发明通过对电动汽车前、后轮轴各自加装驱动电机、每个驱动电机分别设置储能模块，在保证电动汽车动力性的同时便于高效率的制动能量回收。