本发明涉及一种基于单体蓄电池组的蓄电池储能系统，包括供电母线、以及数个与供电母线相连接的单体蓄电池组，各个单体蓄电池组分别包括电池槽、微型双向变换器、微型电池控制装置、以及设置在电池槽内的蓄电池；其中，蓄电池经过微型双向变换器与供电母线相连，并受控于微型电池控制装置；本发明设计的蓄电池储能系统，基于单体蓄电池组，能够提高系统的储能利用率、可靠性和兼容性；与此相应，本发明设计了用于控制基于单体蓄电池组的蓄电池储能系统的方法，在保证供电的同时，能够有效地提高供电效率，避免不必要的电能浪费，保证电池的使用寿命。