本发明提供一种用于平抑风光功率波动的储能系统出力指导方法及装置，应用于电力技术领域，该方法包括：对风光原始出力数据曲线进行快速傅里叶变换，得到风光原始出力频谱；根据风光原始出力频谱，确定滤波器类型及滤波器截止频率选择区间；针对每一截止频率，采用滤波器算法获得储能系统出力目标曲线；针对各截止频率对应的储能系统出力目标曲线，在设定参考时段内进行积分，将积分结果最接近于零的储能系统出力目标曲线确定为储能系统最优出力曲线；利用最优出力曲线指导储能系统出力。本发明在保证了风光功率平抑效果、波动率达到指标要求的同时，还考虑了如何使得储能系统的能量状态变化情况最优化，整个实现过程简单且容易控制，实用性好。