本发明提出一种基于遗传算法的电池储能电站功率控制方法及其系统，该方法包括步骤A、实时读取电池储能电站的相关数据，并对上述数据进行存储；B、通过遗传算法实时确定出电池储能电站中参与本次功率分配的储能机组；C、计算出参与本次功率分配的储能机组功率命令值；D、将参与功率分配的储能机组的功率命令值进行存储后输出。该系统包括通讯模块、数据存储与管理模块、遗传算法控制模块和功率分配控制模块。本发明的控制方法和系统通过位于工控机中的各模块完成基于遗传算法的电池储能电站功率控制方法，并将数据传至外部监控平台进行监控，可实现对兆瓦级电池储能电站实时功率的有效控制和分配目的。