本发明公开了一种苦荞麸皮的发酵方法，包括如下步骤：（1）取苦荞麸皮，用70～90%（v/v）乙醇提取，提取液回收溶剂后，得粗提物；（2）取pH为6.8～7.2的YPD液体培养基，添加步骤（1）的粗提物，粗提物用量是培养基用量的1/5～1/20（w/w），混匀，接种活化的安琪甜酒曲、甜酒曲或黑曲霉，25～35℃发酵1～4d，即可。本发明还提供了前述发酵方法制得的发酵产物、发酵产物的制药用途，发酵产物与苦荞黄酮提取物在制备联合用药物的用途。本发明发酵方法制得的发酵产物中D-手性肌醇含量高，可用于治疗糖尿病，有较强的实际应用价值。