本发明公开了一种提高风力发电机组疲劳均匀性的有功功率分配方法，该方法包括以下步骤：1）根据风电场0-4小时预测风速、各机组额定功率计算各机组下一控制周期的可用功率；2）根据各机组额定功率、历史有功功率数据、维护历史数据，计算各机组疲劳系数；3）根据调度下达的风电场有功出力任务和各机组额定功率、可用功率、疲劳系数，确定并网运行的机组；4）考虑机组有功出力能力约束，根据各机组疲劳系数，按机组疲劳系数反比例，将风电场有功出力任务分解到并网运行的机组。本发明能在保证风电场的有功功率跟踪调度给定值的前提下，提高风电场各机组疲劳的均匀性，提高各机组维护的同步性，降低风电场维护频率。