本发明提供一种用于保护永磁电机的方法及永磁风力发电机组，该方法包括以下步骤：将所述永磁电机和电网建立电连接；在用于连接永磁电机和电网的电路中串接保护单元；当用于连接所述永磁电机和所述电网的所述电路中出现短路电流时，所述保护单元限制所述永磁电机的短路电流的大小，以避免所述短路电流导致所述永磁电机的永磁体的退磁。该保护方法可以有效地防止永磁体退磁，进而提高永磁风力发电机组的安全性和可靠性，而且可以降低永磁风力发电机组的成本。