本发明公开了一种新鲜芒果核的保鲜方法。成熟芒果的果核中含有芒果黄酮类成份，还含有芒果酮酸、没食子酸、槲皮素、芒果苷等成份，这些成份具有抑制细菌和链格孢菌，高抗氧化活性及清除自由基的生物活性，广泛应用于生物制药和保健品。但取肉后的芒果核常带有果肉残渣及果渣纤维，需要清洗及保鲜。本发明首先利用酶的生物作用，使芒果果肉中的果胶质得以完全分解，从而分解了芒果核上面残留的果肉，减少微生物生长所需的营养成分和水。其次，利用了EM菌的益生作用，采用EM原露水溶液处理后，增加了芒果核的有益菌，减少或者消除有害菌，从而达到保鲜的效果。