本发明公开风力发电机组控制系统和控制方法。所述风力发电机组控制系统包括：风速仪，通过测量风力发电机组所处位置处的风速获得风速数据；仲裁器，从风速仪接收风速数据，基于风速数据执行风速预测，并基于风速预测结果、风力发电机组的叶轮转速、输出扭矩和输出功率来启用正常模式控制器或应急模式控制器；正常模式控制器，对风力发电机组的叶轮转速、输出扭矩和输出功率进行控制；应急模式控制器，首先将叶轮转速限制到安全范围之内，随后控制风力发电机组的输出功率达到最大值。所述风力发电机组控制系统和控制方法既不增加硬件投入，又不损失风力发电机组运行功率，并且同时可保证风力发电机组稳定运行。