本发明公开了一种在线式电磁辐射长期监测系统，包括固定在支撑架组件顶端的电磁辐射监测仪、太阳能供电装置和第一光电转换器；还包括远端的控制箱、第二光电转换器、设置在控制箱内部的数据采集装置、通信装置和供电系统，其中：支撑架组件为绝缘体；太阳能供电装置与电磁辐射监测仪电连接并供电；第一光电转换器通过光纤连接远端的第二光电转换器，供电系统分别与数据采集装置、通信装置电连接并供电；该监测系统，实现对监测端和控制端的供电和供电结构布局的分离，使用独立的供电结构保证了监测系统长时间连续工作，同时远离金属物体，有效的避免了现有技术中电磁辐射监测仪外接或靠近金属导体导致的测量误差。