本发明涉及余甘子在制药中的用途，具体涉及余甘子在制备抗H1N1流感的药物中的应用。本发明所述的抗H1N1流感的药物是余甘子黄酮提取物与常规用量的医学上可接受的辅料混合制成的临床上可接受的制剂。本发明所述的药物对H1N1型流感病毒致细胞病变（CPE）具有明显的抑制作用，在临床上可显著降低感染者肺指数，减轻感染者病毒性肺炎症状。