本发明涉及一种产西索米星的突变株，应用于抗生素制造，属于抗生素制药领域。所述突变株为依纽小单孢菌（Micromonosporainyoensis）HP388，已于2012年3月19日在中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心登记保藏，保藏编号为CGMCCNo.5921。本发明的突变菌株HP388的最显著特征是发酵单位高，生产工艺稳定，便于控制，耗氧量小，成本低，污染小，产品质量好。