本发明公开了一种双轴高精度太阳追踪电机控制器，包括电源接口、单片机和电路板，电路板上设有光敏传感器和4个继电器，光敏传感器位于继电器四周，继电器位于电路板的上方，光敏传感器位于电路板的下方，电路板上设有透光孔，光敏传感器感光面朝上，光敏传感器通过透光孔能接收到太阳光，电源接口通过电源转换电路连接单片机，所述单片机接收光敏传感器的信号后发送控制信号给相应的继电器，所述继电器接收控制信号后使电机发生停止或左、右、俯、仰运转。本发明是基于太阳光线的直线传播和光电效应原理测量太阳方位的仪器，能实现太阳的自动追踪，并且能手动遥控操作，自动追踪精度在3°以内，保证了最大效率的太阳能利用。