本发明公开一种温室机械通风的控制方法和控制系统，其中，所述控制方法用于控制温室的风机，包括如下步骤：获取风机的转速、温室内外的温度、温室内外的湿度和温室的太阳总辐射；基于获取的转速、温室内外的温度、温室内外的湿度和太阳总辐射，根据温室能量平衡模型产生用于控制风机转动的控制信号。本发明基于获取的转速、温室内外的温度、温室内外的湿度以及温室的太阳总辐射，能够实时的获取温室的环境条件，以这些环境条件为基础并根据温室能量平衡模型实时的调整风机的转动，不仅能够控制风机的连续转动，而且，能耗低。