本发明提供一种太阳能光伏组件用无卤阻燃导热有机硅密封材料及其制备方法，制备方法包括如下步骤：（1）制备A组分：将100质量份乙烯基硅油、10～20质量份填料和30～60质量份阻燃剂加入真空捏合机内，在100～150℃、真空度-0.1～-0.06MPa条件下，共混60～100分钟，冷却后用三辊机研磨3次，之后加入0.2～0.5质量份催化剂；（2）制备B组分：将0.5～10质量份含氢硅油、0.2～0.5质量份抑制剂、2～8质量份有机硅增粘剂混合搅拌均匀；（3）将步骤1制得的A组分和步骤2制得的B组分按照质量比100:（2～10）混合均匀，在真空度-0.1～-0.06MPa下脱泡10～30分钟，得到用于太阳能光伏组件的无卤阻燃导热有机硅密封材料。本发明制备的密封材料具有良好的耐湿性，对被密封件的粘结强度高，阻燃效果优异。