本发明公开了一种具有亚波长抗反射结构的聚合物太阳能电池，包括盖板、阴极、给体层、受体层和阳极，给体层为导电聚合物层，导电聚合物层靠近阴极一侧设有亚波长抗反射结构，包括若干个结构尺寸小于等于400nm×400nm×400nm的突起，通过亚波长抗反射结构，大大削弱光的反射作用，有效地束缚住光束，从而提高聚合物太阳能电池的光转化效率。本发明还公开了一种具有亚波长抗反射结构的聚合物太阳能电池的制备方法，采用超声复合热转印的加工方法，通过超声场来降低导电聚合物中共轭分子链间的强刚性，改善导电聚合物的流动特性，以获得更好的压印质量，该方法加工成本低、加工高效，易于工业化生产，具有广阔的应用前景。