本发明公开了一种对月球卫星太阳高能粒子探测器实时数据进行处理的方法。本发明主要是处理月球卫星太阳高能粒子有效载荷下行数据源包，解算科学数据与工程数据，校正数据，消除探测数据和工程数据中存在的各种偏差，利用软件对探测数值和工程数据数值进行实时数据监视显示。本发明有助于实现月球卫星高能粒子探测器的在轨运行控制，确保探测器工作正常，获取正确、有效的科学探测数据，为月球卫星或者其他深空探测卫星的高能粒子探测器数据的实时处理提供支持。