本发明关于一种太阳能换流器系统及其控制方法。该方法包含计算第一换流器及第二换流器的总输出功率；判断该总输出功率是否小于等于临界值；根据判断结果，执行相对应的动作。当太阳能换流器系统的总输出功率小于等于临界值时，控制第一换流器单独输出太阳能换流器系统的总输出功率；当太阳能换流器系统的总输出功率大于临界值时，控制第一换流器及第二换流器同时输出太阳能换流器系统的总输出功率。相较于先前技术，本发明所提供的太阳能换流器系统具有较佳的效率与较低的谐波失真。