本发明公开了一种多能源汇流协调控制系统及其控制方法，控制系统包括直流母线、第一交流/直流变换器、第二交流/直流变换器、双向直流/直流变换器、第三交流/直流变换器、协调控制器、电流/电压检测装置和可外接直流负载的直流/直流变换器以及可外接交流负载的直流/交流变换器；协调控制器可以用于接收电流/电压检测装置所传递的数据信息生成相应的电压控制信号分别传递给相应的第一交流/直流变换器、第二交流/直流变换器、双向直流/直流变换器、第三交流/直流变换器、直流/直流变换器和直流/交流变换器；本发明可以对输入的多路交直流电源进行汇流控制，利用协调控制器协调各电源的电压转换模块，调节直流母线电压的方式，跟踪光伏阵列的最大功率点，降低运行成本。