本发明公开了一种复合型水产微囊开口饵料及其制备方法和应用，该开口饵料由含有不同比例蝇蛆蛋白多肽、食用菌发酵液、乳酸菌、螺旋藻粉、大豆磷脂、植物油为主要原料与海藻酸钠按一定比例混合经高速匀浆后加压喷入CaCl₂溶液中形成微胶囊颗粒并过滤后制成的水产微囊开口饵料。本发明的开口饵料具有微米至毫米不同粒径又可在一定的时间内在水中悬浮，适合刚孵化的水产幼苗在不同生长阶段的食用，可增强机体免疫力，调节肠道生态平衡促进其生长发育，不添加抗生素和脱壳素，且无化学药物残留，符合绿色饵料及饲料添加剂的要求，制备成本低廉、使用方便，可在水产育苗和养殖业领域广泛推广使用。