本申请公开了一种独立微网系统优化设计方法，所述独立微网系统包括柴油发电机、风力发电机、光伏阵列和储能电池，具体的优化方法是指基于独立微网系统的多目标优化设计模型，在优化规划设计模型上，考虑了多台柴油发电机的组合开机方式、储能电池与柴油发电机之间的协调控制策略，使得独立微网系统中的可再生能源利用率更高，运行更经济，更环保；针对系统优化规划设计模型的稳定性，考虑了独立微网稳定性需求的备用容量；在优化规划设计模型的求解算法上，采用基于NSGA-II的多目标遗传算法进行多目标问题求解，从而实现对独立微网系统的经济性、可靠性和环保性三大目标的多目标优化。