本发明公开了一种电网电压不平衡下三相光伏发电系统的谐波电流抑制方法。首先分析电网电压不平衡下光伏发电的功率控制和电流谐波产生机理，包括功率指令和电流指令计算方法，并提出引入α、β调节系数对谐波电流进行灵活调节。再对电网电压不平衡下光伏发电谐波电流特性进行分析计算，包括光伏发电的电流总谐波畸变率及功率波动分析和奇次谐波电流解析计算及分析。在此基础上，考虑各次谐波电流和功率波动限制，建立电压不平衡下光伏发电既满足总谐波畸变率、同时又能满足单次谐波限制的电流调节系数算法及控制方法。最后相关计算公式，得到电网电压不平衡下光伏发电的三相指令电流。本发明能够实现光伏发电功率波动和注入电网谐波的灵活控制。