本发明公开了一种分散式光伏微电网组网及其运行控制方法，整个电网包括多个微电网子模块组成，每个微电网子模块包括蓄电池组、负载、变流器和光伏发电单元，所述蓄电池组、负载和光伏发电单元均连接至变流器，变流器与微电网交流母线连接，其中的变流器即为三电平四桥臂变流器，所述变流器还与微电网能量管理系统相连，所述微电网能量管理系统向变流器发出调度指令，变流器根据调度设置为电压参考节点或设定为PQ节点，输出给定的有功功率和无功功率。采用本发明可提高微电网的电能质量以及组网灵活性。