本发明公开了一种多功能光伏UPS系统及其控制方法，包括光伏电池、第一开关单元、第二开关单元、第三开关单元、第四开关单元、第五开关单元、DC/DC单元、蓄电池、双向DC/DC单元、逆变器单元及控制器单元，所述控制器单元与所述第一开关单元、第二开关单元、第三开关单元、第四开关单元及第五开关单元电性连接，所述逆变器单元、双向DC/DC单元及DC/DC单元分别与所述控制器单元电性连接。本发明通过控制器单元控制第一开关单元、第二开关单元、第三开关单元、第四开关单元及第五开关单元的通断，系统具有UPS、光伏离网发电及光伏并网发电功能，控制器单元优化系统工作模式，提高光伏资源的利用效率，最大限度地发挥效用。