本发明公开了一种用于生物材料的丝胶的制备方法，包括如下步骤：(a)以长吐为原料，除杂、漂洗后，加入纯净水浸泡，得到洗净的长吐；(b)将洗净的长吐进行高温高压脱胶得到脱胶液；(c)酶解；(d)依次采用大孔弱酸性丙烯酸系阳离子交换树脂、大孔弱碱性苯乙烯系阴离子交换树脂、阴阳离子混合型交换树脂纯化；(e)浓缩；(f)精密过滤、冷冻干燥，获得丝胶。本发明采用本身杂质含量较少的长吐，经过清洗、脱胶后，将脱胶液直接用离子交换树脂进行处理，实验证明，本发明得到的最终产物的灰分、铅、汞、砷、菌落总数和大肠杆菌含量的各项指标均大大减低，且具有较高的生物活性，取得了意想不到的效果，更适用于生物材料。