本发明公开了一种超纯水机全自动控制系统及控制方法，涉及一种水净化系统，本发明对反渗透模块排出的浓水进行循环利用；同时超纯水循环控制方法通过消毒能够有效清洗超纯水循环系统，能够保证超纯水循环系统必要的纯净度，消毒液在系统中循环流动，使得消毒效果更加明显、更加彻底，相比传统的超纯水循环装置更加充分的保证了纯净的循环环境。