本发明公开了一种磁标记生物传感器系统。该系统包括检测片、磁场施加装置、探头、微弱信号放大装置以及显示装置；其中，检测片包括无磁性基片及其表面的固定层，第一抗体、待测目标分子、第二抗体与磁性微球；探头是由磁阻传感器元件构成的惠斯登桥臂组；检测状态时，将检测片上的待测目标分子进行磁标记后置入磁场施加装置，利用探头探测磁标记的磁信号并将其转化为电信号，通过微弱信号放大装置放大后在显示装置显示。该系统集成化、小型化，能够实现对待测目标分子的自动、快速、准确、方便的检测，因此在肿瘤标志物检测、食品中残留农药或病菌检测、水体中特点微生物检测等生物传感技术领域具有优良的应用前景。