本发明公开了一种存储系统的控制器架构，涉及计算机存储技术，它是一种片上系统，由管理通道,数据通道和监控通道构成，监控通道连接在管理通道和数据通道；所述管理通道由CPU、内存控制器、管理通道专用总线、串口、管理网口及一些低速外设（如GPIO，LED，I2C等）组成；所述数据通道由外部高速I/O接口，数据通道总线，RAID计算加速，数据通道缓存组成；所述监控通道由监控通道总线、数据通道各部分状态与控制寄存器和中断控制器组成。本发明将存储控制器的管理与数据传输分开，优先满足数据传输性能，可以提高存储控制器的I/O传输与处理能力。